Programa de Pós Graduação em Bioquímica da Universidade Federal do Rio de Janeiro

Infraestrutura

O PPGBq conta com laboratórios e grupos a seguir relacionados, distribuídos em uma área total de aproximadamente 2000 m2, situados no Instituto de Química e em outras unidades da UFRJ, como Escola de Química, Faculdade de Farmácia e Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, na FIOCRUZ (PR) e no Instituto Nacional de Tecnologia (INT-MCTI). O Laboratório de Proteômica (LaBProt) e o Laboratório de Biologia Molecular e Proteômica do Sangue (LabMOPS) estão localizados no Laboratório de Apoio ao Desenvolvimento Tecnológico (LADETEC) do Instituto de Química da UFRJ. 

O PPGBq conta ainda com as seguintes plantas piloto (750 m2):

  • Planta do Laboratório de Bioetanol (LB; IQ-UFRJ) para processamento de biomassas vegetais por rotas biotecnológicas e produção de enzimas hidrolíticas de fungos;
  • Planta para produção de biossurfactantes e bioprodutos recombinantes para aplicações ambientais. Possui um biorreator de 200 L acoplado a membranas densas (patente UFRJ/Petrobrás S/A licenciada em 2013), equipamentos de esterilização e recuperação de biomoléculas com tecnologia de membranas, além de biorreatores de bancada de diferentes volumes para desenvolvimento de inóculo e escalonamento de bioprocessos microbianos; 

UNIDADE PROTEÔMICA
IQ/UFRJ

Professores

Gilberto B. Domont (PQ CNPq 1D e CNE FAPERJ)

Fábio C. S. Nogueira (PQ CNPq 2 e JCNE FAPERJ)

Magno R. Junqueira 

Linhas de Pesquisa

Aplicação de Técnicas Proteômicas e Biocombustíveis 

Estrutura e equipamentos

Espectrômetros de massa de alta resolução e desempenho – LTQ-Orbitrap XL ETD (Thermo Scientific)

LTQ-Orbitrap Velos (Thermo Scientific)

Cromatógrafo líquido de alto desempenho de média e alta pressão – nanoLC EASY1000 (Thermo Scientific)

nanoLC-EASY II (Thermo Scientific)

nanoLC Eksigent 2D Plus (Eksigent)

Sistemas para eletrofocalização IPGPhor (GE Healthcare)

Eletroforese

LTQ-Orbitrap XL ETD

LTQ-Orbitrap XL ETD

LTQ-Orbitrap Velos

LTQ-Orbitrap Velos

LABORATÓRIO DE INVESTIGAÇÃO DE FATORES DE ESTRESSE
IQ/UFRJ; LIFE

Professores

Elis C. A. Eleutherio (PQ CNPq 2 e CNE FAPERJ)

Linhas de Pesquisa

Biologia Celular, Biocombustíveis, Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Microrganismos 

Estrutura e equipamentos

Shakers, microscópios (invertido e de transmissão, fluorescência)

Leitor de microplaca (UV-VIS/luminescência/fluorescência)

HPLC com detector UV-Vis e índice de refração

Fermentador com controle de temperatura

Oxigenação

pH e agitação

Analisador voltamétrico

Potenciostato para medida de consumo celular de oxigênio

HLPC

LABORATÓRIO DE BIOTECNOLOGIA MICROBIANA
IQ/UFRJ; LABIM

Professores

Denise M. G. Freire (PQ CNPq 1A e CNE FAPERJ)

Linhas de Pesquisa

Biotecnologia Microbiana; Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática e Agrobiologia 

Estrutura e equipamentos

Shakers

Câmaras climáticas apropriadas para fermentação no estado sólido com temperatura e umidade controlada (VISOMES PLUS)

Titulador automático MettlerDG 20

Titulador Karl Fischer coulométrico (Metrohm modelo 899)

Sonda de infravermelho MATRIX-MF+ (Bruker)

Cromatógrafos em fase gasosa (SHIMADZU – 2010 e SHIMADZU 2030)

HPLC e liofilizador (MODULYOD – ThermoElectron Corporation)

Biorreatores com membranas

Planta Piloto de Bioprocessos

STR de 150 L

Microfiltração

Membranas de oxigenação não-dispersiva

Osmose inversa

Liofilizador

Biorreatores de bancada de 1 a 10 L

Goniômetro e biorreator de tambor rotatório (Terrafors IS)

BIORREATOR

BIORREATOR

BIORREATOR COM MEMBRANAS

BIORREATOR COM MEMBRANAS

Fotos do Laboratório (LABIM)

LABORATÓRIO DE BIOETANOL
LB; IQ/UFRJ; Bioetanol

Professores

Elba P. S. Bon (PQ CNPq 1C)

Linhas de Pesquisa

Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática, Moléculas de Importância Biotecnológica e Biocombustíveis 

Estrutura e equipamentos

Reatores hidrotérmicos de 1 a 23 L

Moinhos de facas

Moinhos de bolas

Extrusora

Peneirador e moinho vibratório

Shakers

Fermentadores de 10 e 30 L

Módulos de filtração

Liofilizador

Spray-dryer

02 HPLCs

HPAEC

CG

Câmara fria de 4,4 m2

EXTRUSORA

EXTRUSORA

HPAEC-PAD Ionico

HPAEC-PAD Ionico

REATOR 30L

REATOR 30L

LB

LB

LABORATÓRIO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR DE VETORES
LaBMOVE; IQ/UFRJ

Professores

Ana Claudia A. Melo 

Mônica F. M. C. Cardoso 

Linhas de Pesquisa

Tecnologias Aplicadas ao Controle de Artrópodes Vetores e Pragas 

Estrutura e equipamentos

Insetário com microscópio

Estereoscópico

Microscópio bacteriológico

Estufa incubadora BOD

Aquecedor

Umidificador

Gaiolas de criação

Sala climatizada e antessala estruturada para manipulação dos insetos

Capela de fluxo laminar

Equipamento para eletroforese vertical e horizontal

Estufa bacteriológica

Termocicladores para PCR semi-quantitativo

pHmetro

Fotodocumentador

LABORATÓRIO DE MICROBIOLOGIA MOLECULAR E PROTEÍNAS
LAMMP; IQ/UFRJ

Professores

Bianca C. Neves 

Rodrigo V. Almeida 

Márcia R. S. da Silva 

Linhas de Pesquisa

Agrobiologia, Aplicação de Técnicas Proteômicas, Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Micro-organismos, Biotecnologia Microbiana e Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática 

Estrutura e equipamentos

3 Shakers

2 Microscópios (invertido e de transmissão)

Leitor de microplaca (UV-Vis, fluorescência, luminescência)

Espectrofluorímetro

3 Termocicladores para PCR convencional

2 Termocicladores para PCR em tempo real

HPLC com detector UV-Vis e índice de refração

Fermentador com controle de temperatura, oxigenação, pH e agitação

3 Estufas BOD com fotoperíodo e controle de temperatura para germinação e cultivo de plantas

O LAMMP conta ainda com uma casa de vegetação de 10 m2 para cultivos de plantas em maior escala

BIORREATOR

BIORREATOR

FLUORÍMETRO

FLUORÍMETRO

INCUBADORA FOTOPERÍODO

INCUBADORA FOTOPERÍODO

TERMOCICLADORES

TERMOCICLADORES

LABORATÓRIO DE ENGENHARIA DE CULTIVOS CELULARES
LECC; EQ/UFRJ

Professores

Leda R. Castilho (PQ CNPq 1C e CNE FAPERJ)

Linha de Pesquisa

Biologia Celular 

Estrutura e equipamentos

4 Biorreatores com agitação mecânica e aeração por borbulhamento

Sistema de monitoramento em linha de concentração celular (Fogale Biomass Monitor)

Microscópio invertido com dispositivo de fluorescência (Nikon)

Microscópio Quimis

Analisadores de metabólitos (sistema YSI 2700 simples e sistema YSI 2700/2730 com dispositivo para monitoramento em linha em biorreatores)

4 Termocicladores para PCR convencional (Applied Biosystems)

Termociclador para PCR em tempo real (Applied Biosystems)

2 Sistemas de purificação FPLC Äkta Purifier

3 Äkta Explorer

Äkta Pilot (Cytiva)

HPLC (Shimadzu)

Aparelhos de slot-blot (Bio-Rad)

Aparelho para transferência semi-dry (Bio-Rad)

Leitoras de microplacas UV-VIS com agitação e incubação (Biotek, Molecular Devices e Perkin Elmer)

Leitora de microplacas de fluorescência e luminescência (Perkin Elmer)

BIORREATORES

SISTEMA DE PURIFICAÇÃO ÄKTA

SISTEMA DE PURIFICAÇÃO ÄKTA

LABORATÓRIO DE ESTUDOS AVANÇADOS DE MICRORGANISMOS
LEAMER

Professores

André L. S. Santos (PQ CNPq 1A e CNE FAPERJ)

Linha de Pesquisa

Biologia Celular 

Estrutura e equipamentos

4 Capelas de fluxo laminar

Centrífugas (microcentrífuga e centrífuga de mesa)

4 Microscópios ópticos

Estufa de CO2

Leitora de microplacas UV-Vis

Leitora de microplacas de fluorescência

Termociclador de PCR convencional

Sistemas para eletroforese vertical (proteína), horizontal (DNA) e Western blotting

LABORATÓRIO DE ONCOBIOLOGIA MOLECULAR
LabOMol; FF/UFRJ

Professores

Patrícia Zancan (PQ CNPq 2)

Linha de Pesquisa

Biologia Celular 

Estrutura e equipamentos

Salas de cultura de células animais

Câmara de fluxo laminar

Estufa de CO2

Centrífugas refrigeradas

Sistemas para eletroforese e Western blotting

Microscópio invertido

Leitora de microplacas

Espectrofômetros

Espectrofluorímetro

Câmara de hipóxia

Contador de cintilação líquida

Termociclador para PCR convencional

Termociclador para PCR em tempo real

LABORATÓRIO DE BIOCATÁLISE
LaBIC; INT

Professores

Dra. Viridiana S. Ferreira Leitão (PQ CNPq 2)

Dra. Ayla Sant’Ana da Silva (CNPq 2)

Linhas de Pesquisa

Biotecnologia Microbiana, Biocombustíveis e Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática 

Estrutura e equipamentos

Destilador

CG com detectores de FID e TCS (Agilent)

Micro CG com detetor de TCD (Agilent)

HPL com detectores UV-VIS e índice de refração (Thermo)

HPLC com detectores UV-VIS e índice de refração (Shimadzu)

Capela de fluxo laminar, bioanalisador de glicose

Rotaevaporador

Sonicador

Purificador de água

Shakers

Centrífugas

Espectrofotômetro UV-VIS

Tituladores

LABORATÓRIO DE BIOINFORMÁTICA
BioINFO; IQ/UFRJ

Professores

Rafael D. Mesquita 

Linhas de Pesquisa

Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Micro-organismos; Tecnologias Aplicadas ao Controle de Artrópodes Vetores e Pragas 

Estrutura e equipamentos

Sala refrigerada e com rede elétrica estabilizada para acondicionar os servidores:

Dell poweredge 16 cores, 48Gb RAM, 6Tb HD

Dell poweredge 14 cores, 256Gb RAM e 8TB HD

Supermicro 24 cores, 256Gb RAM e 8TB HD

Cluster tipo rocks-cluster com 16 computadores de 8 cores, 16Gb RAM e 1Tb HD, somando 128 cores de processamento

LABORATÓRIO DE BIOQUÍMICA ESTRUTURAL DE PROTEÍNAS
LABEP; IQ/UFRJ

Professores

Cristiane D. Ano Bom 

Linha de Pesquisa

Moléculas de importância biotecnológica 

Estrutura e equipamentos

Câmara de fluxo laminar

Espectrofotômetro UV-Vis

Espectrofotômetro UV-Vis de varredura DU70 (Beckman)

Sonicador de ponta

2 Centrífugas refrigeradas (Sigma)

3 Sistemas de eletroforese vertical (proteínas) e horizontal (DNA) (BioRad)

Sistema de purificação FPLC Äkta (Cytiva)

Shaker refrigerado (New Brunswick)

LABORATÓRIO DE BIOQUÍMICA MOLECULAR
LaBMol; IQ/UFRJ

Professores

Anderson Pinheiro (CNPq 2)

Linhas de Pesquisa

Moléculas de Importância Biotecnológica; Agrobiologia 

Estrutura e equipamentos

Câmara de fluxo laminar

Espectrofotômetro UV-Vis (Hitachi)

Centrífugas refrigeradas (Beckman e Hettich)

2 Sistemas de eletroforese vertical (proteínas) e 1 horizontal (DNA) (Bio-rad)

2 Sistemas de purificação FPLC Äkta (Cytiva)

2 Shakers refrigerados (New Brunswick)

1 Purificador de água millQ (Millipore)

Sonicador de ponta e microscópio óptico

LABORATÓRIO DE CITOTOXICIDADE E GENOTOXICIDADE
LaCiGen; IQ/UFRJ

Professores

Marcos D. Pereira  (PQ CNPq 2)

Linhas de Pesquisa

Citotoxidade e Genotoxicidade de Drogas  

Estrutura e equipamentos

2 Câmaras de fluxo laminar

2 Centrifugas

Espectrofotômetro UV-Vis

3 Shakers

2 Banho termostatado

Sistema de eletroforese vertical (proteína) e horizontal (DNA)

Microscópio invertido

ncubadora de CO2

LABORATÓRIO DE BIOLOGIA MOLECULAR E PROTEÔMICA DO SANGUE
LaBMOPS; IQ/UFRJ

Professores

Luciana Pizzatti  (PQ CNPq 2)

Linha de Pesquisa

Aplicação de Técnicas Proteômicas 

Estrutura e equipamentos

4 Termocicladores para PCR (2 termocicladores para PCR convencionais; 1 PCR em tempo real automatizado com robô e 1 equipamento de PCR digital)

Plataforma de sequenciamento de nova geração baseado em chip (PGM Ion Torrent)

Sequenciamento de Sanger

Microscópio de fluorescência (Evos)

Câmara de fluxo laminar, estufa de CO2

Sistema de eletroforese vertical (proteínas) e horizontal (DNA)

Certificado de Conformidade de Sistema de Gestão na categoria PRATA NBR ISO 9001, COPPE / UFRJ 2019

LABORATÓRIO DE PROTEÔMICA
LaBProt; IQ/UFRJ

Professores

Fábio C. S. Nogueira  (CNPq PQ 2 e JCNE FAPERJ)

Linhas de Pesquisa

Aplicação de Ténicas Proteômicas; Agrobiologia 

Estrutura e equipamentos

Espectrômetros de massa de alta resolução e desempenho – Q-Exactive Plus (Thermo Scientific)

Espectrômetros de massa de triplo quadrupolo – TSQ Quantiva (Thermo Scientific)

Cromatógrafo liquido de alto desempenho de média e alta pressão – nanoLC EASY1000 (Thermo Scientific)

NanoLC-EASY II (Thermo Scientific)

3 UHPLC Dionex 3000 (Thermo Scientific)

Sistema para eletrofocalização OFFGel (Agilent)

Sistemas de eletroforese

Sistema de eletrotransferência semi-dry (Blotting)

Scanner para géis (Cytiva)

NanoDrop

Thermomixer

Speed-Vac

Centrífugas refrigeradas

LABORATÓRIO DE PROTEÔMICA ESTRUTURAL E COMPUTACIONAL
FIOCRUZ-PR

Professores

Paulo C. Carvalho  (PQ CNPq 2)

Linha de Pesquisa

Aplicação de Ténicas Proteômicas 

Estrutura e equipamentos

O laboratório é composto de duas salas. A primeira, um laboratório computacional com 5 computadores. A segunda, um laboratório voltado para proteômica, contendo os equipamentos necessários, como centrífuga refrigerada, termobloco, eletroforese, etc. O laboratório utiliza as plataformas tecnológicas de espectrometria de massa da FIOCRUZ-PR.

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