INFRAESTRUTURA
O PPGBq conta com laboratórios e grupos a seguir relacionados, distribuídos em uma área total de aproximadamente 2000 m2, situados no Instituto de Química e em outras unidades da UFRJ, como Escola de Química, Faculdade de Farmácia e Instituto de Microbiologia Paulo de Góes, na FIOCRUZ (PR) e no Instituto Nacional de Tecnologia (INT-MCTI). O Laboratório de Proteômica (LaBProt) e o Laboratório de Biologia Molecular e Proteômica do Sangue (LabMOPS) estão localizados no Laboratório de Apoio ao Desenvolvimento Tecnológico (LADETEC) do Instituto de Química da UFRJ.
O PPGBq conta ainda com as seguintes plantas piloto (750 m2):
- Planta do Laboratório de Bioetanol (LB; IQ-UFRJ) para processamento de biomassas vegetais por rotas biotecnológicas e produção de enzimas hidrolíticas de fungos;
- Planta para produção de biossurfactantes e bioprodutos recombinantes para aplicações ambientais. Possui um biorreator de 200 L acoplado a membranas densas (patente UFRJ/Petrobrás S/A licenciada em 2013), equipamentos de esterilização e recuperação de biomoléculas com tecnologia de membranas, além de biorreatores de bancada de diferentes volumes para desenvolvimento de inóculo e escalonamento de bioprocessos microbianos;
Professores
Gilberto B. Domont (PQ CNPq 1D e CNE FAPERJ)
Fábio C. S. Nogueira (PQ CNPq 2 e JCNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Aplicação de Técnicas Proteômicas e Biocombustíveis.
Estrutura e equipamentos
Espectrômetros de massa de alta resolução e desempenho – LTQ-Orbitrap XL ETD (Thermo Scientific)
LTQ-Orbitrap Velos (Thermo Scientific)
Cromatógrafo líquido de alto desempenho de média e alta pressão – nanoLC EASY1000 (Thermo Scientific)
nanoLC-EASY II (Thermo Scientific)
nanoLC Eksigent 2D Plus (Eksigent)
Sistemas para eletrofocalização IPGPhor (GE Healthcare)
Eletroforese
LTQ-Orbitrap XL ETD
LTQ-Orbitrap Velos
Professora
Elis C. A. Eleutherio (PQ CNPq 2 e CNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Biologia Celular, Biocombustíveis, Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Microrganismos.
Estrutura e equipamentos
Shakers, microscópios (invertido e de transmissão, fluorescência)
Leitor de microplaca (UV-VIS/luminescência/fluorescência)
HPLC com detector UV-Vis e índice de refração
Fermentador com controle de temperatura
Oxigenação
pH e agitação
Analisador voltamétricoPotenciostato para medida de consumo celular de oxigênio
HLPC
Professora
Denise M. G. Freire (PQ CNPq 1A e CNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Biotecnologia Microbiana; Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática e Agrobiologia
Estrutura e equipamentos
Shakers
Câmaras climáticas apropriadas para fermentação no estado sólido com temperatura e umidade controlada (VISOMES PLUS)
Titulador automático (MettlerDG 20)
Titulador Karl Fischer coulométrico (Metrohm modelo 899)
Sonda de infravermelho MATRIX-MF+ (Bruker)
Cromatógrafos em fase gasosa (SHIMADZU – 2010 e SHIMADZU 2030)
HPLC e liofilizador (MODULYOD – ThermoElectron Corporation)
Biorreatores com membranas
Planta Piloto de Bioprocessos
STR de 150 L
Microfiltração
Membranas de oxigenação não-dispersiva
Osmose inversa
Liofilizador
Biorreatores de bancada de 1 a 10 L
Goniômetro e biorreator de tambor rotatório (Terrafors IS)
BIORREATOR
BIORREATOR COM MEMBRANAS
Fotos do Laboratório (LABIM)
Professora
Elba P. S. Bon (PQ CNPq 1C)
Linhas de Pesquisa
Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática, Moléculas de Importância Biotecnológica e Biocombustíveis.
Estrutura e equipamentos
Reatores hidrotérmicos de 1 a 23 L
Moinhos de facas
Moinhos de bolas
Extrusora
Peneirador e moinho vibratório
Shakers
Fermentadores de 10 e 30 L
Módulos de filtração
Liofilizador
Spray-dryer
02 HPLCs
HPAEC
CGCâmara fria de 4,4 m2
Visão geral do laboratório
Cromatógrafo de Íons
Reator Hidrotérmico PARR
Fermentador 30L
Extrusora e Moinho de bolas
HPLC
Reator Hidrotérmico 20L
Fermentador 10L
Professoras
Ana Claudia A. Melo
Mônica F. M. C. Cardoso
Linhas de Pesquisa
Tecnologias Aplicadas ao Controle de Artrópodes Vetores e Pragas.
Estrutura e equipamentos
Insetário com microscópio
Estereoscópico
Microscópio bacteriológico
Estufa incubadora BOD
Aquecedor
Umidificador
Gaiolas de criação
Sala climatizada e antessala estruturada para manipulação dos insetos
Capela de fluxo laminar
Equipamento para eletroforese vertical e horizontal
Estufa bacteriológica
Termocicladores para PCR semi-quantitativo
pHmetro
Fotodocumentador
Professores
Bianca C. Neves
Rodrigo V. Almeida
Márcia R. S. da Silva
Linhas de Pesquisa
Agrobiologia, Aplicação de Técnicas Proteômicas, Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Micro-organismos, Biotecnologia Microbiana e Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática.
Estrutura e equipamentos
3 Shakers
2 Microscópios (invertido e de transmissão)
Leitor de microplaca (UV-Vis, fluorescência, luminescência)
Espectrofluorímetro
3 Termocicladores para PCR convencional
2 Termocicladores para PCR em tempo real
HPLC com detector UV-Vis e índice de refração
Fermentador com controle de temperatura, oxigenação, pH e agitação
3 Estufas BOD com fotoperíodo e controle de temperatura para germinação e cultivo de plantas
O LAMMP conta ainda com uma casa de vegetação de 10 m2 para cultivos de plantas em maior escala
BIORREATOR
FLUORÍMETRO
INCUBADORA FOTOPERÍODO
TERMOCICLADORES
Professora
Leda R. Castilho (PQ CNPq 1C e CNE FAPERJ)
Linha de Pesquisa
Biologia Celular
Estrutura e equipamentos
4 Biorreatores com agitação mecânica e aeração por borbulhamento
Sistema de monitoramento em linha de concentração celular (Fogale Biomass Monitor)
Microscópio invertido com dispositivo de fluorescência (Nikon)
Microscópio Quimis
Analisadores de metabólitos (sistema YSI 2700 simples e sistema YSI 2700/2730 com dispositivo para monitoramento em linha em biorreatores)
4 Termocicladores para PCR convencional (Applied Biosystems)
Termociclador para PCR em tempo real (Applied Biosystems)
2 Sistemas de purificação FPLC Äkta Purifier
3 Äkta Explorer
Äkta Pilot (Cytiva)
HPLC (Shimadzu)
Aparelhos de slot-blot (Bio-Rad)
Aparelho para transferência semi-dry (Bio-Rad)
Leitoras de microplacas UV-VIS com agitação e incubação (Biotek, Molecular Devices e Perkin Elmer)
Leitora de microplacas de fluorescência e luminescência (Perkin Elmer)
BIORREATORES
SISTEMA DE PURIFICAÇÃO ÄKTA
Professor
André L. S. Santos (PQ CNPq 1A e CNE FAPERJ)
Linha de Pesquisa
Biologia Celular.
Estrutura e equipamentos
4 Capelas de fluxo laminar
Centrífugas (microcentrífuga e centrífuga de mesa)
4 Microscópios ópticos
Estufa de CO2
Leitora de microplacas UV-Vis
Leitora de microplacas de fluorescência
Termociclador de PCR convencionalSistemas para eletroforese vertical (proteína), horizontal (DNA) e Western blotting
Professora
Patrícia Zancan (PQ CNPq 2 e CNE FAPERJ)
Linha de Pesquisa
Biologia Celular.
Estrutura e equipamentos
Salas de cultura de células animais
Câmara de fluxo laminar
Estufa de CO2
Centrífugas refrigeradas
Sistemas para eletroforese e Western blotting
Microscópio invertido
Leitora de microplacas
Espectrofômetros
Espectrofluorímetro
Câmara de hipóxia
Contador de cintilação líquida
Termociclador para PCR convencional
Termociclador para PCR em tempo real
Professoras
Dra. Viridiana S. Ferreira Leitão (PQ CNPq 2)
Dra. Ayla Sant’Ana da Silva (PQ CNPq 2 e JCNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Biotecnologia Microbiana, Biocombustíveis e Desenvolvimento de Tecnologia Enzimática.
Estrutura e equipamentos
Destilador
CG com detectores de FID e TCS (Agilent)
Micro CG com detetor de TCD (Agilent)
HPL com detectores UV-VIS e índice de refração (Thermo)
HPLC com detectores UV-VIS e índice de refração (Shimadzu)
Capela de fluxo laminar, bioanalisador de glicose
Rotaevaporador
Sonicador
Purificador de água
Shakers
Centrífugas
Espectrofotômetro UV-VISTituladores
Professor
Rafael D. Mesquita
Linhas de Pesquisa
Bioinformática, Metabolismo e Engenharia Metabólica de Micro-organismos; Tecnologias Aplicadas ao Controle de Artrópodes Vetores e Pragas.
Estrutura e equipamentos
Sala refrigerada e com rede elétrica estabilizada para acondicionar os servidores:
Dell poweredge 16 cores, 48Gb RAM, 6TB HD
Dell poweredge 14 cores, 256Gb RAM e 8TB HD
Supermicro 24 cores, 256Gb RAM e 8TB HD
Cluster tipo rocks-cluster com 16 computadores de 8 cores, 16Gb RAM e 1TB HD, somando 128 cores de processamento
Professora
Cristiane D. Ano Bom
Linha de Pesquisa
Moléculas de importância Biotecnológica.
Estrutura e equipamentos
Câmara de fluxo laminar
Espectrofotômetro UV-Vis
Espectrofotômetro UV-Vis de varredura DU70 (Beckman)
Sonicador de ponta
2 Centrífugas refrigeradas (Sigma)
3 Sistemas de eletroforese vertical (proteínas) e horizontal (DNA) (BioRad)
Sistema de purificação FPLC Äkta (Cytiva)Shaker refrigerado (New Brunswick)
Professor
Anderson S. Pinheiro (PQ CNPq 2 e CNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Moléculas de Importância Biotecnológica; Agrobiologia.
Estrutura e equipamentos
Câmara de fluxo laminar
Espectrofotômetro UV-Vis (Hitachi)
Centrífugas refrigeradas (Beckman e Hettich)
2 Sistemas de eletroforese vertical (proteínas) e 1 horizontal (DNA) (Bio-rad)
2 Sistemas de purificação FPLC Äkta (Cytiva)
2 Shakers refrigerados (New Brunswick)
1 Purificador de água millQ (Millipore)
1 Sonicador de ponta (Ecosonics)
1 Microscópio de fluorescência Evos M5000 (Thermo Sicentific)
1 Leitora de microplacas Multiskan SkyHigh (Thermo Scientific)
Professor
Marcos D. Pereira
Linhas de Pesquisa
Citotoxidade e Genotoxicidade de Drogas.
Estrutura e equipamentos
2 Câmaras de fluxo laminar
2 Centrifugas
Espectrofotômetro UV-Vis
3 Shakers
2 Banho termostatado
Sistema de eletroforese vertical (proteína) e horizontal (DNA)
Microscópio invertido
ncubadora de CO2
Professora
Luciana Pizzatti
Linha de Pesquisa
Aplicação de Técnicas Proteômicas.
Estrutura e equipamentos
4 Termocicladores para PCR (2 termocicladores para PCR convencionais; 1 PCR em tempo real automatizado com robô e 1 equipamento de PCR digital)
Plataforma de sequenciamento de nova geração baseado em chip (PGM Ion Torrent)
Sequenciamento de Sanger
Microscópio de fluorescência (Evos)
Câmara de fluxo laminar, estufa de CO2
Sistema de eletroforese vertical (proteínas) e horizontal (DNA)
Certificado de Conformidade de Sistema de Gestão na categoria PRATA NBR ISO 9001, COPPE / UFRJ 2019
Professor
Fábio C. S. Nogueira (CNPq PQ 2 e JCNE FAPERJ)
Linhas de Pesquisa
Aplicação de Ténicas Proteômicas; Agrobiologia.
Estrutura e equipamentos
Espectrômetros de massa de alta resolução e desempenho – Q-Exactive Plus (Thermo Scientific)
Espectrômetros de massa de triplo quadrupolo – TSQ Quantiva (Thermo Scientific)
Cromatógrafo liquido de alto desempenho de média e alta pressão – nanoLC EASY1000 (Thermo Scientific)
NanoLC-EASY II (Thermo Scientific)
3 UHPLC Dionex 3000 (Thermo Scientific)
Sistema para eletrofocalização OFFGel (Agilent)
Sistemas de eletroforese
Sistema de eletrotransferência semi-dry (Blotting)
Scanner para géis (Cytiva)
NanoDrop
Thermomixer
Speed-Vac
Centrífugas refrigeradas
Professor
Magno R. Junqueira
Linha de Pesquisa
Aplicação de Ténicas Proteômicas.
Estrutura e equipamentos
Espectrômetros de massa de alta resolução e desempenho – LTQ-Orbitrap XL ETD (Thermo Scientific)
LTQ-Orbitrap Velos (Thermo Scientific)
Cromatógrafo líquido de alto desempenho de média e alta pressão – nanoLC EASY1000 (Thermo Scientific)
nanoLC-EASY II (Thermo Scientific)
nanoLC Eksigent 2D Plus (Eksigent)
Sistemas para eletrofocalização IPGPhor (GE Healthcare)
Eletroforese